Disciplina Curricular
Métodos Estatísticos em Bioinformática MEBio
Mestrado Bolonha em Bioinformática e Biologia Computacional - 2_MBBC 2023/24
Contextos
Grupo: 2_MBBC 2023/24 > 2º Ciclo > Parte Escolar > Opcionais > 2º Semestre > 633_MBBC - Opcionais Livres (CEI/CVIDA/CMAT)
Período:
Peso
3.0 (para cálculo da média)
Objectivos
Os métodos Bioinformáticos são frequentemente baseados em modelos estatísticos, quer nas estratégias inerentes à resolução de problemas, quer na forma como a inferência é usada para encontrar evidência e quantificar a confiança. Recorrendo aos conhecimentos adquiridos anteriormente na disciplina "Bioestatística para Bioinformática", esta unidade curricular (uc) procura ilustrar de que forma estes métodos Bioinformáticos são desenvolvidos e em que contexto podem e deve ser usados. A componente prática da uc tem por base o ambiente R.
Programa
1 - Conceitos Estatísticos de Relevo para a Bioinfomática: Algoritmo EM. Cadeias de Markov, cadeias de Markov escondidas, MCMC e amostragem de Gibbs. Problema dos testes múltiplos: valor-p, FWER, FDR. 2 - Análise de grandes conjuntos de dados: Redução da dimensionalidade dos dados. Métodos de classificação supervisionada e não supervisionada. Metodologias estatísticas para análise de dados de ómicas - teste de permutação, métodos bayesianos, métodos baseados em modelos lineares, métodos não-paramétricos baseados em ordens, métodos baseados em contagens.
Métodos de ensino e avaliação
A avaliação consiste na realização de um Trabalho Individual: o trabalho será realizado em R e pretende-se que os alunos explorem alguns packages do Bioconductor, compreendam a metodologia estatística utilizada e apliquem a dados reais.