Disciplina Curricular
Métodos Quantitativos em Biologia de Sistemas MQBS
Mestrado Bolonha em Bioinformática e Biologia Computacional - 2_MBBC 2023/24
Contextos
Grupo: 2_MBBC 2023/24 > 2º Ciclo > Parte Escolar > Opcionais > 2º Semestre > 633_MBBC - Opcionais Livres (CEI/CVIDA/CMAT)
Período:
Peso
6.0 (para cálculo da média)
Objectivos
Apresenta as principais abordagens computacionais na análise de sistemas biológicos complexos, incluindo análise de redes biológicas, com enfâse em redes de interação proteína-proteína e a sua associação a patologias, modelos dinâmicos de sistemas biológicos, modelos lógicos de redes regulatórias e de sinalização e modelos de escala genómica de redes metabólicas. Várias abordagens são exploradas através de projectos computacionais com execução acompanhada.
Programa
Análise estrutural de redes biológicas: -Análise de topologia de redes biológicas -Modelos baseados em distribuição de fluxos em estado estacionário Análise dinâmica de redes biológicas: -Modelação dinâmica determinística de redes biológicas. -Modelação dinâmica estocástica de redes biológicas. -Modelos lógicos de redes biológicas. -Métodos de exploração do espaço de parâmetros. Integração e inferência de redes biológicas com dados de larga escala: -Uso de redes biológicas para análise de dados de larga escala -Ajustamento de modelos a dados de séries temporais para determinação de parâmetros e estrutura do modelo. Princípios de design biológico: -Motivos de redes
Métodos de ensino e avaliação
Método de avaliação Exame escrito (50%), questões sobre pequenos projectos computacionais feitos em aula durante o semestre (25%), projecto computacional realizado em grupo (25%)