Disciplina Curricular
Métodos Computacionais em Genética e Evolução MCGE
Mestrado Bolonha em Bioinformática e Biologia Computacional - 0_MBBC 2008/09 a 2016/17
Peso
3.0 (para cálculo da média)
Objectivos
Os modelos clássicos de genética e evolução tendem a ser generalistas e simples, permitindo um estudo analítico bastante completo, mas a maior parte dos modelos mais recentes são demasiado complexos para isso. Mesmo quando existem soluções explícitas, podem ser muito difíceis de encontrar "à mão", pelo que é comum recorrer-se a sistemas algébricos computacionais. Além deste estudo analítico, é também útil fazer estudos numéricos e gráficos, quer para testar os resultados analíticos quer para os completar, por vezes sugerindo a forma de novas soluções analíticas aproximadas. Além disso, alguns modelos são expressos desde o início como modelos computacionais simulativos, incluindo autómatos celulares e modelos baseados no comportamento individual. O objectivo desta disciplina é estudar alguns destes modelos recentes usando computadores. Espera-se que os alunos fiquem assim aptos a estudar em profundidade os modelos existentes, e a desenvolver eles próprios novos modelos biológicos.
Programa
A disciplina é baseada no estudo computacional de vários modelos de genética e evolução. O conjunto de modelos a estudar pode ser algo flexível, dependendo dos interesses expressos pelos alunos. De qualquer forma, o cerne do programa é formado por uma selecção dos tópicos indicados na secção seguinte. Cada módulo é constituído por uma introdução teórica ao assunto, seguida do estudo computacional dos modelos respectivos, discussão e conclusões. O primeiro módulo é indispensável (excepto se todos os alunos tiverem já exposição suficiente), pois o Matlab será a principal plataforma computacional a usar.
Métodos de ensino e avaliação
Exposição do material de base em aulas teóricas, exploração detalhada e alargada das questões em aulas computacionais, discussão dos resultados.A discutir com os alunos.