Disciplina Curricular
Biologia Computacional na Prática Biomédica BCPB
Mestrado Bolonha em Bioinformática e Biologia Computacional - 0_MBBC 2008/09 a 2016/17
Peso
3.0 (para cálculo da média)
Objectivos
Esta cadeira tem sido lecionada pela Post-doc Ana Rita Grosso do Instituto de Medicina Molecular (IMM). A Doutora Ana Rita tem realizado trabalho na área da Bioinformática com reconhecido mérito e competência. Realizou o seu doutoramento em análise dados de microarrays e posteriormente desenvolveu os seus conhecimentos à área da investigação em Bioinformática aplicada às Ciências Biomédicas, nomeadamente no estudo da expressão génica com Next Generation Sequencing (NGS). As aulas com a duração de cerca de 30 horas de contacto distribuídas por uma semana, nas instalações da FCUL. Este curso é uma oportunidade para os alunos do mestrado contactarem com a investigação a ser feita numa vertente de aplicação biomédica num instituto de referência como o IMM. Pretende-se com esta cadeira a aquisição de conhecimentos específicos e operacionais na área de investigação em Bioinformática e de Biologia Computacional aplicados na prática Biomédica.
Programa
Introdução às técnicas de análise de dados de RNAseq e ChipSeq. Explicação destas técnicas, aplicações biomédicas e perspetiva da Biologia Computacional. Os fundamentos teóricos das técnicas e dos processos biológicos que medem. Bases de dados repositórios desta informação, formatos de trabalho e workflow do processamento destes dados. Apresentação gráfica de resultados. Seminários de apresentação de papers nesta área e resolução de exercícios com dados NGS.
Métodos de ensino e avaliação
As aulas são essencialmente informativas, com recurso a datashow e computadores. As aulas são administradas em salas dotadas de computadores, em que os alunos exploram informaticamente os conceitos desenvolvidos e aprendem a analisar e interpretar resultados de experiencias bioinformáticas. Os seminários, consistem em apresentações individuais de um artigo científico. É ainda feita a discussão de artigos científicos por toda a turma. A nota resulta do seminário apresentado pelos alunos, da subsequente discussão e da participação geral na cadeira, incluindo um trabalho final individual.