Objectivos

Mestrado Bolonha em Bioinformática e Biologia Computacional

Nos últimos 15 anos, desenvolvimentos de tecnologias de sequenciação de próxima geração (NGS) causaram uma revolução numa variedade de áreas e aplicações biológicas. Este curso é uma introdução prática à análise de dados NGS, com foco na plataforma Illumina. Abordará etapas fundamentais da bioinformática NGS, incluindo: como usar bancos de dados públicos (NCBI Short Read Archive); como realizar controle de qualidade e trimming de dados de sequenciação; e como implementar protocolos para mapeamento de short reads e identificação de SNPs. Em seguida, introduzirá diferentes aplicações dos dados de Illumina na investigação em biologia evolutiva, incluindo a detecção da estrutura populacional; a inferência de histórias filogenómicas de espécies; e abordagens genómicas para detectar seleção natural. No final deste curso os alunos serão capazes de compreender, escrever e implementar pipelines bioinformáticas fundamentais para análise de dados NGS em diferentes áreas de investigação biológica.