Bases de dados  e ferramentas de pesquisa I

27 Fevereiro 2019, 15:00 • Margarida Henriques da Gama Carvalho

Origem da informação disponível nas bases de dados. Necessidade de anotações e ferramentas para gerar conhecimento a partir da informação. Formas e tipos de anotação. Anotação automática de ORFs(Open Reading Frames); proteínas hipotéticas. Tipos de ferramentas. A diferença entre base de dados, interface e algoritmos de pesquisa/análise. Necessidade de formatos de dados standardizados(FASTA, flat). Organização das bases de dados – o modelo DAS. Principais repositórios de informação biológica – NCBI, EMBL/EBI e DDBJ (InternationalNucleotideSequenceDatabaseCollaboration). Outras instituições/repositórios de referência – UCSC GenomeBrowser; SangerCenterUK/Vega GenomeBrowser; Flybase; SwissInstituteofBioinformatics/Expasy.