Sumários

Estimação de parâmetros

7 Março 2018, 09:00 António Eduardo do Nascimento Ferreira

Estimação de parâmetros em modelos cinéticos: introdução ao método, detalhes da implementação, algoritmos genéticos e software a usar. Aplicação a exemplos simples. Aplicação à estimação de parâmetros no modelo de Lipniack de transdução de sinal. Parâmetros não-identificáveis. Discussão geral. Recomendações sobre a aplicação do método aos resultados do módulo de Imunoblotting.


Preparação das aulas práticas

2 Março 2018, 08:00 Maria Margarida Blasques Telhada

Preparação dos materiais e soluções necessários para as aulas práticas


Simulação da via de ativação do NF-kB

1 Março 2018, 08:00 Fernando Jose Nunes Antunes

Modelo de Lipniacki sobre o NF-kB
  • Efeito da duração do estímulo
  • Estudo da delecção dos genes IkBalpha e A20
  • Efeito do quociente volume citosol sobre volume do núcleos
  • Estudo da sobrexpressão do NF-kB e do IkBalpha 


Simulação da via de ativação do NF-kB

28 Fevereiro 2018, 09:00 Fernando Jose Nunes Antunes

Introdução ao PLAS
Modelo minimal do NF-kB
  • Montagem
  • Análise
  • Importância da retroacção negativa
  • Importância do sinal ativador
Modelo de Lipniacki et al. sobre o NF-kB
  • Geração do esquema reaccional
  • Cálculo dos tempos de resposta


Estimação de parâmetros

23 Fevereiro 2018, 08:00 António Eduardo do Nascimento Ferreira

Estimação de parâmetros em modelos cinéticos: introdução ao método, detalhes da implementação, algoritmos genéticos e software a usar. Aplicação a exemplos simples. Aplicação à estimação de parâmetros no modelo de Lipniack de transdução de sinal. Parâmetros não-identificáveis. Discussão geral. Recomendações sobre a aplicação do método aos resultados do módulo de Imunoblotting.