Sumários
Estimação de parâmetros
5 Abril 2017, 09:00 • António Eduardo do Nascimento Ferreira
Estimação de parâmetros em modelos cinéticos: introdução à metodologia. A natureza do problema, vantagens e desvantagens, algoritmos usados. Ilustração com modelos simples. Estimação de parâmetros no modelo de transdução de sinal do NFkB. Parâmetros identificáveis.
Estimação de parâmetros
29 Março 2017, 09:00 • António Eduardo do Nascimento Ferreira
Estimação de parâmetros em modelos cinéticos: introdução à metodologia. A natureza do problema, vantagens e desvantagens, algoritmos usados. Ilustração com modelos simples. Estimação de parâmetros no modelo de transdução de sinal do NFkB. Parâmetros identificáveis.
Simulação da Via do NF-KB
23 Março 2017, 10:00 • Fernando Jose Nunes Antunes
Continuação da análise de um modelo complexo da via do NFkB
1. Estudo do efeito da duração do estímulo da via do NFkB.
a) Geração de hipóteses.
b) Teste de hipóteses.
c) Discussão.
2. Análise do "knock-out" dos genes IkBa e A20 na via do NF-kB.
3. Implementação de modelos com vários compartimentos espaciais.
a) Efeito do quociente entre o volume do citosol e do núcleo na dinâmica do NFkB.
5. Estudo do efeito de sobre-expressão dos genes IkBa e NFkB na dinâmica do NFkB.
Simulação da Via do NF-KB
22 Março 2017, 09:00 • Fernando Jose Nunes Antunes
1. Introdução ao Plas.
2. Montagem de um modelo minimal da via do NF-kB.
a) Análise do efeito da retroacção negativa.
3. Análise de um modelo complexo da via do NF-kB.
a) Construção de um esquema reaccional a partir de equações diferenciais.
b) Determinação de tempos de resposta.
Estimação de parâmetros
22 Março 2017, 09:00 • António Eduardo do Nascimento Ferreira
Estimação de parâmetros em modelos cinéticos: introdução à metodologia. A natureza do problema, vantagens e desvantagens, algoritmos usados. Ilustração com modelos simples. Estimação de parâmetros no modelo de transdução de sinal do NFkB. Parâmetros identificáveis.