Genoma 2: Estudo de genomas humanos para traços complexos (GWAS)

9 Março 2020, 10:30 • Federico Herrera Garcia

Nesta aula, foi apresentado pelos alunos um artigo sobre a análise integrativa de dados resumidos de omics de traços complexos (Wu et al. Nature Communications 2018) em uma apresentação de 15 minutos. Resumo: A identificação de genes e elementos reguladores subjacentes às associações descobertas pelo GWAS é essencial para a compreensão da etiologia de características complexas. Os autores desenvolveram um paradigma analítico de priorização de genes e elementos reguladores nos loci do GWAS para estudos funcionais de acompanhamento. Eles realizaram uma análise integrativa que usou dados SNP em nível de resumo de estudos multi-ômicos para detectar locais de metilação do DNA (DNAm) associados à expressão e fenótipo de genes através de efeitos genéticos compartilhados (ou seja, pleiotropia). Eles identificaram associações pleiotrópicas entre um alto número de locais e genes específicos de DNAm. Esses locais de DNAm são enriquecidos em potenciadores e promotores, e mais de 40% deles são mapeados para genes distais. As análises pleiotrópicas posteriores associaram o metiloma e o transcriptoma a 12 características complexas. Após uma rodada de perguntas selecionadas por seus colegas, os alunos passaram a apresentar um distúrbio genético (Síndrome de Marfan) em uma apresentação de três slides, seguida por uma nova rodada de perguntas e considerações finais.