Expressão Génica: Reprogramação celular

20 Abril 2020, 10:30 • Federico Herrera Garcia

Nesta aula, os alunos apresentaram um artigo sobre o transcriptoma de células estaminais pluripotentes induzíveis (Marcel Schiebinger et al. Cell 2019) numa apresentação de 15 minutos. Resumo:A compreensão dos programas moleculares que orientam a diferenciação durante o desenvolvimento é um grande desafio. Aqui, apresentamos Waddington-OT, uma abordagem para estudar cursos de tempo de desenvolvimento para inferir os destinos dos antepassados e modelar os programas regulamentares que lhes estão subjacentes. Aplicamos o método para reconstruir a paisagem da reprogramação a partir de 315.000 perfis de sequenciação de RNA de célula única (scRNA-seq), recolhidos a intervalos de meio dia ao longo de 18 dias. Os resultados revelam uma gama mais ampla de programas de desenvolvimento do que os anteriormente caracterizados. As células adoptam gradualmente ou um estado terminal do estroma ou um estado de transição mesenquimal-epitelial. Este último dá origem a populações relacionadas com células pluripotentes, extra-embrionárias e neurais, com cada uma delas abrigando múltiplas subpopulações mais finas. A análise prevê factores de transcrição e sinais parácrinos que afectam os destinos e experiências validam que a TF Obox6 e a citocina GDF9 aumentam a eficiência da reprogramação. A nossa abordagem lança luz sobre o processo e o resultado da reprogramação e fornece um quadro aplicável a diversos processos temporais em biologia... Após uma ronda de perguntas seleccionadas pelos seus colegas, os estudantes procederam à apresentação de uma desordem genética (Esquizofrenia) numa apresentação em 3 slides seguida de uma nova ronda de perguntas e comentários finais.