Correlações sequência, estrutura, função. Padrões determinísticos e PSSM.

6 Outubro 2017, 11:00 • António Eduardo do Nascimento Ferreira

Generalidades sobre a classificação de proteínas em famílias: a interseção entre a classificação e a previsão funcional. Aspetos quantitativos sobre a determinação da estrutura e função a partir da sequência. Medidas quantitativas da semelhança de sequência e semelhança estrutural.
Classificação de proteínas em famílias e deteção de domínios a partir da sequência. Os alinhamentos múltiplos de sequências revistas como ponto de partida para a classifcação de sequências novas. Padrões determinísticos. O portal PROSITE. O desempenho de classificadores binários. A matriz de confusão, Sensibilidade, recall, especificidade e precisão. Problemas no desempenho de padrões determinísticos. As Position Specific Scoring Matrices. Os perfis probabilísticos no PROSITE.