Correlações sequência, estrutura, função. Padrões determinísticos e PSSM.
6 Outubro 2017, 11:00 • António Eduardo do Nascimento Ferreira
Generalidades sobre a classificação de proteínas em famílias: a
interseção entre a classificação e a previsão funcional. Aspetos
quantitativos sobre a determinação da estrutura e função a partir da
sequência. Medidas quantitativas da semelhança de sequência e semelhança
estrutural.
Classificação de proteínas em famílias e deteção de domínios a partir da
sequência. Os alinhamentos múltiplos de sequências revistas como ponto
de partida para a classifcação de sequências novas. Padrões
determinísticos. O portal PROSITE. O desempenho de classificadores
binários. A matriz de confusão, Sensibilidade, recall, especificidade e precisão. Problemas no desempenho de padrões determinísticos. As Position Specific Scoring Matrices. Os perfis probabilísticos no PROSITE.