Classificação de proteínas em famílias e deteção de domínios a partir da sequência.

27 Setembro 2019, 11:00 • António Eduardo do Nascimento Ferreira

O Protein Data Bank como base de dados e portal de resultados estruturais. Ficheiros PDB e coordenadas atómicas. Fundamentos sobre a cristalografia de raios X de macromoléculas biológicas: lei da Bragg, cristalização de proteínas, difração e fatores e estrutura, fontes de raios X, densidades electrónicas e modelos estruturais. Validação de modelos estruturais.Classificação de proteínas em famílias e deteção de domínios a partir da sequência. Os alinhamentos múltiplos de sequências revistas como ponto de partida para a classificação de sequências novas. Padrões determinísticos. O portal PROSITE.  As Position Specific Scoring Matrices. Os perfis probabilísticos no PROSITE. Os Hidden Markov Models: objetivos e construção a partir dos alinhamentos múltiplos. Mecanismo, Porbabilidades de geração de símbolos e transições. Aplicação à calssificação de sequências. O portal PFam: famílias e domínios.