Detecção e sequenciação de SARS-Cov-2

26 Novembro 2020, 12:00 • Patricia Beldade

Seguimento do SARS-CoV-2: esforço nacional e internacional. Testes de diagnóstico de SARS-CoV-2 usando “quantititive real-time PCR””: “primers” para gene viral e para gene humano como controlo, valores de CT. Seguimento da origem e grupos de transmissão do SARS-CoV-2 usando técnicas de NGS (Nanopore e Illumina) e uma estratégia de amplificação do genoma viral via PCR multiplex com 98 pares de “primers”. Obtenção do primeiro genoma viral com recursos a RNA-seq e uma estratégia que enriquecia o RNA viral em detrimento do RNA do hospedeiro. Organização do genoma viral, taxa de mutação e identificação de “clusters”.  Plataformas públicas de armazenamento e visualização dos dados de sequência. Heterogeneidade nos efeitos de infecção com SARS: idade, sexo e factores genéticos ainda não conhecidos que podem ser estudados, por exemplo, com recurso a uma abordagem GWAS. 

Aula lecionada em zoom pelo convidado, especialista em DNA sequencing & analysis, Doutor Ricardo Leite, coordenador da Unidade de Genómica do Instituto Gulbenkian de Ciência.