Marcadores neutrais e caracterização do espectro mutacional e estrutura populacional

29 Outubro 2020, 12:00 • Vítor Sousa

Utilização de marcadores neutrais para estimar taxas de mutação e espectro mutacional (mutational spectrum). Cálculo do número esperado de SNPs numa zona genómica neutral. Introdução a medidas e métodos para caracterizar a estrutura populacional: (1) FST para quantificar a diferenciação genética com base em frequências alélicas; (2) métodos para agrupamento de indivíduos com base em dados de vários loci (Structure e PCA). Distinção entre métodos de agrupamento (clustering) baseados em modelos de genética populacional (STRUCTURE) e métodos de exploração de dados sem modelos biológicos subjacentes (PCA - Principal Component Analysis). Interpretação de resultados de FST, Structure e PCA. Isolamento por distância e efeito de amostragem.