Tecnologias de sequenciação NGS, RADseq e PoolSeq

8 Outubro 2020, 12:00 • Vítor Sousa

Princípio de métodos de Next Generation Sequencing, comparando as tecnologias Illumina, Pacific Biosystems e Oxford Nanopore. Passos no protocolo NGS: preparação da biblioteca genómica, amplificação, sequenciação. Tratamento dos dados: conceito de depth of coverage e quantificação da incerteza em dados NGS, e aplicação para detectar SNPs e estimar genótipos (SNP calling and genotype calling). Aplicações de sequenciação Illumina para sequencias individuos de espécies não modelo (RADseq) e sequenciar pools de indivíduos.