Marcadores neutrais, caracterização de estrutura populacional e como identificar hibridização

8 Novembro 2022, 15:30 • Bruno Miguel Santos de Almeida Nevado

Introdução a medidas e métodos para caracterizar a estrutura populacional: (1) FST para quantificar a diferenciação genética com base em frequências alélicas; (2) métodos para agrupamento de indivíduos com base em dados de vários loci (Structure e PCA). Distinção entre métodos de agrupamento (clustering) baseados em modelos de genética populacional (STRUCTURE) e métodos de exploração de dados sem modelos biológicos subjacentes (PCA - Principal Component Analysis). Interpretação de resultados de FST, Structure e PCA. Isolamento por distância e efeito de amostragem. Princípios da utilização de marcadores neutrais para inferir a história demográfica com base em modelos. Árvores de genes e árvores de espécies. Incongruencia filogenética, hibridização e introgressão, e incomplete lineage sorting. Identificação de introgressão com testes “abba-baba”, exemplo de introgressão de DNA de neandartais para humanos.