Métodos básicos de anotação da cromatina

28 Fevereiro 2019, 11:00 • Rui Artur Paiva Loureiro Gomes

Exemplos de utilização de RNA-seq e outros métodos de análise à escala genómica para elucidar a estrutura e expressão génica nos projetos modENCODE. Breve revisão da estrutura da cromatina, nucleossomas, modificações pós-tradução e “código das histonas”. Modelo de propagação das marcas epigenéticas. Métodos básicos de anotação da cromatina: DNASE-SEQ, DNASE-CHIP, ChIP-CHIP, ChIP-SEQ, FAIRE-SEQ e BS-SEQ. Exemplos de aplicação destes métodos nos projetos ENCODE para elucidar a estrutura e função da cromatina. Assinaturas típicas da transcrição, das origens de replicação e dos diversos tipos de heterocromatina. As enigmáticas regiões HOT (elevada ocupação de fatores de transcrição). As principais conclusões do projeto ENCODE e suas controvérsias.