Métodos de análise dos elementos estruturais e funcionais à escala do genoma

5 Março 2020, 11:00 • Rui Artur Paiva Loureiro Gomes

Métodos de análise dos elementos estruturais e funcionais à escala do genoma ("genome-wide"): Microarranjos de DNA ("microarrays") e sequenciação de elevado rendimento ("high-throughput next-generation sequencing (NGS)", "deep sequencing", ou "massive parallel sequencing"). Microarranjos de um canal ou dois canais. Microarranjos de exões ("exon arrays") e microarranjos de genoma ladrilhado ou imbricado ("tiling arrays"). Comparação da qualidade e do tipo de informação retirada da análise de microarrays e de NGS. Princípios e comparação dos métodos de sequenciação de RNA e DNA  por next-generation sequencing (NGS) e por Third-Generation Sequencing (TGS, long reads). Exemplos de utilização de RNA-seq e outros métodos de análise à escala genómica para elucidar a estrutura e expressão génica nos projetos modENCODE. Breve revisão da estrutura da cromatina, nucleossomas, modificações pós-tradução e “código das histonas”. Modelo de propagação das marcas epigenéticas. Exemplos de modificações nas caudas das histonas, de proteínas "binding" que as reconhecem e que por sua vez são reconhecidas por proteínas "writers"  que a estas se ligam.. A complexidade do "código epigenético".