Avaliação pratica

26 Novembro 2025, 09:00 • Octavio Fernando de Sousa Salgueiro Godinho Paulo

Apresentação e explicação de  bash scripts para análise de dados genómicos pelo alunos.

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Pratica de Git e GitHub

19 Novembro 2025, 09:30 • Octavio Fernando de Sousa Salgueiro Godinho Paulo

Pratica de Git e GitHub

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Repositórios

19 Novembro 2025, 09:00 • Octavio Fernando de Sousa Salgueiro Godinho Paulo

Repositórios

Git e GitHub. Introdução ao uso do Git. Introdução ao uso do GitHub. O GitLab, Zenodo, DRYAD.

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Introdução ao Bash scripting

12 Novembro 2025, 09:30 • Octavio Fernando de Sousa Salgueiro Godinho Paulo

Exercícios com bash scripting

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Pipelines e Workflows

12 Novembro 2025, 09:00 • Octavio Fernando de Sousa Salgueiro Godinho Paulo

Pipelines e Workflows. Os workflow engines. Reproductibilidade. Escalabilidade, portabilidade, automação. Snakemake. Nextflow. Repositórios, o nf-core, o WorkflowHub, Sanger-Tol. Galaxy project

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