Sumários
T10
16 Maio 2022, 16:00 • Lélia Chambel
O conceito de identificação/diagnóstico/deteção.
Métodos usados para o diagnóstico de microrganismos.
Os métodos de diagnóstico baseados em PCR: harmonização e padronização.
Validação de métodos de diagnóstico molecular.
T9
9 Maio 2022, 16:00 • Lélia Chambel
Homologias/semelhanças DNA-DNA: ensaios em solução e ensaios com DNA imobilizado em membranas; aplicabilidade taxonómica.
A molécula de rRNA como marcador taxonómico e filogenético; culturas puras e mistas.
O uso da sequência total do genoma na identificação de procariotas: “average nucleotide identity” (ANI) e “digital DDH” (dDDH).
O conceito de diferenciação/tipificação. O conceito de “fingerprinting”. Critérios para avaliação de sistemas de diferenciação.
Polimorfismos de amplificação e restrição.
Métodos genómicos de diferenciação: Polimorfismos de restrição de DNA total (RFLP e macrorestrição); Métodos baseados em PCR (RAPD, MSP-PCR, MLVA); Análise de sequências (MLST).
T8
2 Maio 2022, 16:00 • Lélia Chambel
Análise de perfis de ácidos gordos (FAMEs).
Frações proteicas em quimiotaxonomia: uma visão geral.
Análise de proteínas celulares totais por SDS-PAGE.
Análise de proteínas por MALDI-TOF-MS.
A perspetiva molecular na classificação.
Vantagens dos sistemas de identificação baseadas em dados moleculares. As diferentes abordagens da taxonomia molecular.
Dimensão genómica e teor molar de G+C.
T7
11 Abril 2022, 16:00 • Lélia Chambel
Identificação fenotípica versus identificação molecular: tipo de carateres e de técnicas. Resolução taxonómica de uma técnica.
Componentes químicos celulares e análise taxonómica. Fatores que afetam a qualidade da identificação.
Tipo de carateres utilizados em bacteriologia.
Tipo de carateres utilizados em micologia.
Sistemas de identificação baseados em processos sequenciais.
Sistemas de identificação baseados em processos simultâneos.
Fluxo experimental e analítico dos estudos de quimiotaxonomia. Reprodutibilidade e fiabilidade dos estudos quimiotaxonómicos. Métodos quimiotaxonómicos de identificação.