Técnicas de obtenção de organismos transgénicos.

11 Outubro 2021, 10:00 • Rita Zilhão

Técnicas de obtenção de organismos transgénicos. O que é um organismo transgénico, objectivos da sua construção e suas aplicações. Como se geram animais transgénicos – a escolha do transgene, as estratégias da construção molecular e a expressão do transgene. As células alvo na construção de um transgénico.  Métodos de transferência génica. A inserção aleatória, os efeitos de posição e gene targeting. Os cruzamentos necessários para a obtenção do transgene. A noção de organismo founder. Estratégias de seleção de inserção em locais específicos. Sistemas de expressão induzíveis (Tet ON/Tet OFF) e condicionais (os sistemas Cre/loxP e FLP/FRT). Modificação dirigida de genomas através de nucleases específicas e o sistema CRISPR. Confirmação da obtenção de um transgene. Transgénicos em diferentes modelos animais (ratinho, galinha, zebrafish).  Preocupações éticas.  

Técnicas de obtenção de organismos transgénicos.

11 Outubro 2021, 09:00 • Rita Zilhão

Técnicas de obtenção de organismos transgénicos. O que é um organismo transgénico, objectivos da sua construção e suas aplicações. Como se geram animais transgénicos – a escolha do transgene, as estratégias da construção molecular e a expressão do transgene. As células alvo na construção de um transgénico.  Métodos de transferência génica. A inserção aleatória, os efeitos de posição e gene targeting. Os cruzamentos necessários para a obtenção do transgene. A noção de organismo founder. Estratégias de seleção de inserção em locais específicos. Sistemas de expressão induzíveis (Tet ON/Tet OFF) e condicionais (os sistemas Cre/loxP e FLP/FRT). Modificação dirigida de genomas através de nucleases específicas e o sistema CRISPR. Confirmação da obtenção de um transgene. Transgénicos em diferentes modelos animais (ratinho, galinha, zebrafish).  Preocupações éticas.  

TP Genómica

8 Outubro 2021, 09:00 • Rita Zilhão

Teórica: Alinhamento de sequências e sequência consensus. Identidade, similaridade e homologia, genes ortólogos e parálogos. Assemblagem e anotação de genomas. Identidade, similaridade e homologia, genes ortólogos e parálogos. Assemblagem e anotação de genomas.

Prática: Apresentação de do software bioinformático Geneious: ligação ao GenBank para pesquisa por genes e nucleótidos. Alinhamento de sequências e identificação de regiões de identidade. Desenho de primers para amplificação de genes específicos. Pesquisa de motivos característicos presentes em regiões conservadas.

Os alunos estão dispensados desta TP na medida em que não vão ser avaliados sobre este tema.

TP Genómica

8 Outubro 2021, 08:00 • Rita Zilhão

Teórica: Alinhamento de sequências e sequência consensus. Identidade, similaridade e homologia, genes ortólogos e parálogos. Assemblagem e anotação de genomas. Identidade, similaridade e homologia, genes ortólogos e parálogos. Assemblagem e anotação de genomas.

Prática: Apresentação de do software bioinformático Geneious: ligação ao GenBank para pesquisa por genes e nucleótidos. Alinhamento de sequências e identificação de regiões de identidade. Desenho de primers para amplificação de genes específicos. Pesquisa de motivos característicos presentes em regiões conservadas.

Os alunos estão dispensados desta TP na medida em que não vão ser avaliados sobre este tema.

Genómica

6 Outubro 2021, 10:00 • Rita Zilhão

Genómica: Métodos Biomoleculares utilizados na Genómica. Revisão de alguns conceitos: De onde provém a variabilidade do genoma, com particular destaque para SNPs e InDel. A sequenciação pelo método Sanger e novas plataformas de sequenciação de genomas (NGS): Roche 454, Illumina e Nanopore; principais diferenças entre os vários métodos de sequenciação, vantagens e desvantagens de cada uma delas.