Design metabólico: Regulação da expressão génica

29 Março 2017, 12:30 • Fernando Jose Nunes Antunes

Circuitos genéticos: sistema indutível e reprimível.
Comparação com sistemas experimentais.

Design metabólico: Regulação da expressão génica

28 Março 2017, 13:00 • Fernando Jose Nunes Antunes

Aplicação dos sistemas S à análise de design da regulação da expressão génica

• Controlo por activador ou pelo repressor – adicionar activador ou remover repressor?
  
• Escrita do esquema reaccional
  
• Teoria da demanda.
  
• Sistemas catabólicos e anabólicos.
  
• Ciclo de vida do fago lambda.

Design metabólico

22 Março 2017, 12:30 • Fernando Jose Nunes Antunes

SistemasS: comparação de designs alternativos de retroacção negativa(conclusão).

Análise dos seguintes critérios funcionais:

6. Estabilidade
7. Resposta rápida

Demostração de uma análise de desgin metabólico com o Software wxMaxima.

Design metabólico

21 Março 2017, 13:00 • Fernando Jose Nunes Antunes

Comparação de designs alternativos de retroacção negativa (continuação).

Análise dos seguintes critérios funcionais:

1. Baixa acumulação dos intermediários
metabólicos
2. Minimização da alteração do produto final em
resposta a uma alteração da sua necessidade
3. Redução da síntese dos intermediários quando o
produto é fornecido externamente
4. Resposta elevada a uma alteração da
disponibilidade do substrato inicial
5. Robustez a alterações da estrutura do sistema

Design metabólico

15 Março 2017, 12:30 • Fernando Jose Nunes Antunes

Sistemas S:

• Comparação de designs alternativos de retroacção negativa (continuação).
• Comparação matemática controlada.
• Equivalência interna e externa.