Sistemas S e acaso em bioquímica

11 Abril 2022, 10:00 • Fernando Jose Nunes Antunes

Sistemas S:

• Determinação experimental dos parâmetros do sistema S:
• Noção de ponto operacional.
  
• Ordens cinéticas para leis de velocidade comuns:
• Henri-Michaelis-Menten;
  
• HMM com inibição competitiva;
  
• equação de Hill;
• inibição competitiva com cooperatividade.
  
• Sistema S como uma aproximação em torno do ponto operacional.

• Pequenos números.
• Distribuição de Poisson.
• A experiência de Luria e Delbruck.

Sistemas S (continução)

4 Abril 2022, 10:00 • Fernando Jose Nunes Antunes

Sistemas S:

• Análise de design matabólico – aplicação a uma via linear com retroacção negativa.
  
• Linearização de sistemas S.
  
• Obtenção analítica do estado estacionário.
• Ganho logarítmico.

Bioquímica de sistemas: representação simbólica de sistemas bioquímicos:

28 Março 2022, 10:00 • Fernando Jose Nunes Antunes

Representação simbólica de sistemas bioquímicos

• Variáveis dependentes e independentes
• Fuxos de matéria e de informação
• Simplificações espaciais, temporais e funcionais

• Construção de Sistemas S (exemplos)

Abordagem não molecular: Termodinâmica

21 Março 2022, 10:00 • Fernando Jose Nunes Antunes

Percolação (continuação).

• Rede de mitocôndrios num cardiomiócito.
• Criticalidade no desacoplamento mitocondrial em cardiomiócitos.
• Microscopia de dois fotões.
• Observação in vivo do sincronização do desacoplamento mitocondrial no coração.
• Implicações na isquémia-reperfusão.

• Relação entre cinética e termodinâmica
• Design metabólico
• Seleção entre vias glicolíticas alternativas
• Opção entre glicólise ou respiração mitocondrial
• Energia dissipada como um biomarcador metabólico
• Calorimetria
• Resposta a complexidade e deficiências nos meio de cultura

Abordagem não molecular: Teoria da percolação

14 Março 2022, 10:00 • Fernando Jose Nunes Antunes

Percolação.