Sumários
Modelação cinética: aproximações e simplificações
26 Março 2018, 09:00 • António Eduardo do Nascimento Ferreira
Simplificação de modelos cinéticos: equilíbrios rápidos, aproximações de
estados quase estacionários. Exemplo com um modelo simples da parte
superior da glicólise.
Relações de conservação
20 Março 2018, 11:00 • António Eduardo do Nascimento Ferreira
Relações de conservação em modelos cinéticos: ilustração com o artigo de Meyer e Stryer e com um mecanismo de Michaelis-Menten da ação enzimática. O cálculo das relações de conservação por análise estequiométrica: o espaço das relações de conservação e o cálculo de uma base. A redução da dimensão dos sistema de equações diferenciais de um modelo cinético.
Transdução de sinal por ião cálcio
19 Março 2018, 12:00 • António Eduardo do Nascimento Ferreira
Preparação da análise do artigo de Meyer e Stryer sobre a transdução de sinal baseada no ião cálcio.
Modelo da transdução de sinal por ião cálcio
19 Março 2018, 09:00 • António Eduardo do Nascimento Ferreira
Análise do artigo de Meyer e Stryer: construção do modelo básico: justificação e aproximações nas leis de velocidade. Unidades dos parâmetros. Cálculo dos estados estacionários e biestabilidade. Extensão do modelo de modo a prever oscilações.
Pontos de bifurcação em vários exemplos
13 Março 2018, 11:00 • António Eduardo do Nascimento Ferreira
Cálculo dos estados estacionários por simulação a partir de vários valores iniciais e resolvendo as equações algébricas dxi/dt =0. Estudo da estabilidade de pontos fixos por variação dos valores próprios do jacobiano com um parâmetro do modelo. Exemplo do modelo de inibição mútua e das oscilações de cálcio intraceleular.