Programa

Simulação Bioquímica

Licenciatura Bolonha em Bioquímica

Programa

I - Biologia de Sistemas Computacional: 1) Introdução à simulação em Bioquímica. 2) Metodologias de construção de modelos. 3) Análise numérica de modelos baseados em ODEs. II - Visualização e modelação de estrutura de biomoléculas: 1) Visualização tridimensional da estrutura de proteínas. 2) Modelação estrutural de proteínas. III - Modelação de interacções proteína-ligando: 1) Preparação de bases de dados de ligandos. 2) Docking molecular e scoring functions. 3) High-Throughput Virtual Screening (HTVS). IV - Dinâmica Molecular: 1) Princípios da mecânica molecular e do uso de campos de forças. 2) Simulações de dinâmica molecular de proteínas e ligandos. 3) Estudo do espaço conformacional em sistemas fármaco/ proteína alvo e o seu impacto em várias aplicações terapêuticas.