Disciplina Curricular
Bioinformática Aplicada às Ciências da Vida BACV
Mestrado Bolonha em Biologia Humana e Ambiente - 2_MBHA 2023/24
Contextos
Grupo: 2_MBHA 2023/24 > 2º Ciclo > Parte Escolar > MBHA - Opcionais Livres 1º Semestre > Bloco A (Saúde) > 624_MBHA - Bloco A (CVIDA)
Período:
Peso
3.0 (para cálculo da média)
Objectivos
Transmitir conceitos e métodos de bioinformática num contexto de aplicação a casos práticos. Resultados expectáveis da aprendizagem No final do curso o aluno deverá demonstrar: 1. Uma compreensão sistemática das situações em que cada um dos métodos estudados na UC é mais adequado; 2. Domínio de técnicas de “plotting” avançadas; 3. Capacidade de "montar" um genoma com base em "reads" e uma referência; 4. Saber lidar com dado de metagenómica em diferentes contextos. Competências a desenvolver No final do curso o aluno deverá ser capaz de: 1. Saber aplicar a metodologia bioinformática mais adequada para responder a questões biológicas comuns da área; 2. Saber utilizar ferramentas avançadas de “plotting” para visualização de conjuntos de dados complexos; 3. Saber usar uma interface de linha de comandos em ambiente *NIX; 4. Saber interpretar resultados comuns de experiências de metagenómica.
Programa
Ao longo da UC os estudantes serão “confrontados” com diversos problemas de natureza biológica. As competências estatísticas e de ciências da computação são assim introduzidas aos alunos, sempre dentro de um contexto biológico. Estas competências abordarão formas avançadas de visualização de dados biológicos, use de software de bioinformática em ambientes de computação de alto desempenho (montagem de genomas e metagenómica), e uma breve introdução a métodos de aprendizagem automática.
Métodos de ensino e avaliação
Todas as aulas são dadas em laboratórios de computação. As aulas teóricas são dinâmicas com exemplos práticos a acompanhar cada conjunto de conceitos. Nas aulas teórico-práticas os alunos aprendem a resolver exercícios, analisar e interpretar dados, por prática individual (ou em pequenos grupos informais, se assim o entenderem). A avaliação é realizada através de três componentes: o contexto de sala de aula (20%), "Flash talks" com apresentação de poster (30%), e um exame final (50%).