Disciplina Curricular
Simulação Bioquímica SBioqu
Licenciatura Bolonha em Bioquímica - 6_LBioq 2022/23
Contextos
Grupo: 6_LBioq 2022/23 > 1º Ciclo > Licenciatura em Bioquímica ou Minor > Minor em Química > 114_Opção IV - LBioq com Minor (CVIDA)
Período:
Grupo: 6_LBioq 2022/23 > 1º Ciclo > Licenciatura em Bioquímica ou Minor > Minor em Informática > 114_Opção IV - LBioq com Minor (CVIDA)
Período:
Grupo: 6_LBioq 2022/23 > 1º Ciclo > Licenciatura em Bioquímica ou Minor > Minor em Física > 114_Opção IV - LBioq com Minor (CVIDA)
Período:
Grupo: 6_LBioq 2022/23 > 1º Ciclo > Licenciatura em Bioquímica ou Minor > Minor em Biologia > 114_Opção IV - LBioq com Minor (CVIDA)
Período:
Grupo: 6_LBioq 2022/23 > 1º Ciclo > Licenciatura em Bioquímica ou Minor > Licenciatura em Bioquímica > Opcionais > 111_Opção I (QA)
Período:
Peso
6.0 (para cálculo da média)
Objectivos
Nesta disciplina pretende-se que os estudantes desenvolvam conhecimentos fundamentais nas áreas de Bioquímica e Biologia de Sistemas, com ênfase especial nos aspectos de modelação e simulação cinética de base computacional e análise de redes de celulares.
Programa
Generalidades sobre simulação em Bioquímica. O conceito de modelo. Vários tipos de simulação Metodologias de construção de modelos. Análise numérica e simbólica de modelos baseados em de FDEs e ODEs. Análise estequiométrica e de sensibilidade. Análise estocástica de processos celulares. Redes celulares: introdução à teoria de grafos. Tipos de grafos, principais propriedades e teoremas. Redes celulares e biologia de sistemas: motivos de rede, difusão em redes, modularidade e exemplos de aplicação.
Métodos de ensino e avaliação
Aulas presenciais com forte componente computacional, análise de exemplos em grupo com discussão colectiva Monografia sobre análise de um artigo fornecido com apresentação oral na aula. Exame final oral ou escrito com acesso a meios computacionais.