Sumários
Avaliação
28 Março 2025, 08:30 • Margarida Henriques da Gama Carvalho
Teste de avaliação contínua - componente de bioinformática
Avaliação
27 Março 2025, 16:00 • Margarida Henriques da Gama Carvalho
Teste de avaliação contínua - componente de bioinformática
Da expressão génica à anotação funcional
19 Março 2025, 15:00 • Margarida Henriques da Gama Carvalho
Genómica funcional e perfis comparativos de proteoma e transcritoma: métodos experimentais e bases de dados. PRIDE: repositório de dados de proteómica e suas ferramentas de pesquisa. Array Express e Expression Atlas – bases de dados de transcritómica centradas na experiência ou no gene. Necessidade de regras de normalização das anotações de dados experimentais: exemplo do protocolo MIAME. Integração da informação em vias (Pathways) – Reactome.
O Gene Ontology Project: origens e objectivos. Definição de ontologia. Gene Ontology – características, hierarquização de termos, relações entre termos e códigos de evidência. Aplicação da Gene Ontology na comparação e previsão funcional: abordagem geral e aplicação concreta.
Da mutação à função proteica e terapêutica
14 Março 2025, 08:30 • Margarida Henriques da Gama Carvalho
Conhecer um conjunto de ferramentas e bases de dados que permitem fazer previsões sobre estrutura e função de proteínas (Uniprot e Prosite; Translate, ProtParam, PSort, Scan Prosite e Clustal W)
Compreender as ferramentas de tradução de ácidos nucleicos, identificando os diferentes quadros de leitura e o “Open Reading Frame” (ORF) principal
Conhecer a base de dados Uniprot, as anotações que contém e ferramentas de pesquisa incorporadas, descarregar ficheiros multi-fasta e utilizar e interpretar o resultado de algoritmos de alinhamento múltiplo
Compreender o conceito de dendrograma baseado em semelhanças de sequências e a sua relação com os processos de evolução biológica
Da mutação à função proteica e terapêutica
13 Março 2025, 16:00 • Margarida Henriques da Gama Carvalho
Conhecer um conjunto de ferramentas e bases de dados que permitem fazer previsões sobre estrutura e função de proteínas (Uniprot e Prosite; Translate, ProtParam, PSort, Scan Prosite e Clustal W)
Compreender as ferramentas de tradução de ácidos nucleicos, identificando os diferentes quadros de leitura e o “Open Reading Frame” (ORF) principal
Conhecer a base de dados Uniprot, as anotações que contém e ferramentas de pesquisa incorporadas, descarregar ficheiros multi-fasta e utilizar e interpretar o resultado de algoritmos de alinhamento múltiplo
Compreender o conceito de dendrograma baseado em semelhanças de sequências e a sua relação com os processos de evolução biológica