IMPORTANTE: ANALISE CALCOFLUOR WHITE
12 Dezembro 2019, 12:06 • Federico Herrera Garcia
Bom dia a todos- Esta nota pode ser relevante para todos os grupos 3 e 4 todas as PLs, porque utilizaram calcofluor white nas suas amostras. O seu colega Miguel Ribeiro fez questão de pesquisar um bocadinho no analise das imagens de calcofluor, porque encontrava que deixava de fora muitas células que estavam no limiar do threshold e nas quais só se colorava a parede (apareciam como um anel depois de aplicar o threshold). Nestas células só contaba a área fluorescente (a parede), e não a área de todo o corpo das células, dando valores inferiores aos esperados para o tamanho da célula observado a olho. Ele mesmo resolveu o problema fazendo click no Analyze>Analyze particles>Include Holes. Desta maneira o programa inclui no cálculo a área dentro do anel, e os valores tornam-se mais reais. Esto não resolve o problema de aquelas células nas quais o perímetro seja discontinuo, porque então o interior não é reconhecido como um "Hole". Estas células deveram por tanto ser excluidas do analise.
Se já fizeram o análise e acham
que os datos representam a realidade, fiquem lá e defendam as suas
observações. Se não, pode ser recomendável repetir as suas
quantificações. Lembrem que o objetivo da microscopia é que descrevam o
melhor possível o que estão a observar.
Podem resolver dúvidas dos detalhes com o seu colega ou conmigo, mas vocês são os últimos responsáveis do seu análise!!
Cumprimentos,