A investigação desenvolvida pelo Professor Howard Griffiths, tem-se focado nos processos moleculares, fisiológicos e ambientais que regulam a produtividade e o sequestro de CO₂, visando melhorar a eficiência operacional da Rubisco, em face da disponibilidade hídrica. Tem utilizado metodologias com isótopos estáveis para avaliar a origem e regulação de diversos mecanismos de concentração de carbono fotossintéticos (CCM). Estes incluem a via C4 e o metabolismo das plantas crassuláceas (CAM), bem como o CCM biofísico em algas e antocerotas, com particular foco nos determinantes moleculares dos pirenóides do cloroplasto. Num contexto de diversidade natural, o seu trabalho tem-se focado cada vez mais na investigação visando a resiliência dos sistemas agronómicos e a promoção da segurança alimentar e da igualdade. A sua vertente do ensino tem sido dirigida para a área das Ciências Naturais associada a diversas aulas de campo, em particular em Portugal. Desde 2014 é membro da “Royal Society of Biology” e de 2015 da “Linnean Society”. É ainda membro de mais de 25 comissões e organizações.