Sumários

Estabilidade proteica e cinética de folding

25 Outubro 2019, 11:00 Cláudio Emanuel Moreira Gomes

Determinação da estabilidade proteica e métodos experimentais.
Breves noções sobre métodos experimentais para análise estrutural e folding de proteínas: calorimetria diferencial de varrimento e espectroscopias de fluorescência e dicroísmo circular. Estabilidade proteica e cinética de folding  As ligações químicas envolvidas na estabilidade de proteínas e suas magnitudes. O efeito hidrofóbico e sua interpretação. Influência de factores extrínsecos (cofactores,modificações pós –traducionais e pontes dissulfureto).  


Apresentação de artigos

25 Outubro 2019, 09:30 António Eduardo do Nascimento Ferreira

Apresentação de artigos: artigos sobre previsão estrutural e avaliação de modelos.


Folding de proteínas: conceitos fundamentais e termodinâmica.

18 Outubro 2019, 11:00 Cláudio Emanuel Moreira Gomes

A diversidade estrutural de proteinas e introdução ao problema do folding de proteínas Generalidades sobre a diversidade estrutural de proteinas. O problema do folding de proteínas: perspectiva histórica e desafios actuais. As proteínas como entidades dinâmicas: dinâmica e flexibilidade da conformação proteica.   A experiência de Anfinsen e a hipótese termodinâmica.  A experiência de Anfinsen e a hipótese termodinâmica do processo de folding proteico. Definição de estado nativo e unfolded. A cinética da reacção de folding proteico: o paradoxo de Levinthal e o conceito de funil energético. 


Apresentação de artigos

18 Outubro 2019, 09:30 António Eduardo do Nascimento Ferreira

Apresentação de artigos: artigos sobre previsão estrutural e avaliação de modelos.


Previsão estrutural de proteínas

11 Outubro 2019, 11:00 António Eduardo do Nascimento Ferreira

A previsão da estrutura proteíca (3D) a partir da sequência: as dificuldades e a competição CASP. A modelação por homologia: objetivo e fundamento, fases fundamentais, Medidas de qualidade dos modelos obtidos (QMEAN4) e limitações dos resultados. O portal SwissModel. A pesquisa de templates, a modelação e a otimização final por campo de forças empírico. Outros métodos de previsão de estrutura: método threading e métodos do tipo Rosetta.