Sumários

Introdução ao traçado de filogenias com base em dados moleculares

16 Maio 2025, 16:00 Margarida Maria Demony de Carneiro Pacheco de Matos

Construção de filogenias com dados de sequências de RNA de diferentes coronavirus. Diferentes passos da construção de filogenias com base em dados moleculares foram abordados: (i) alinhamento de sequências; e (ii) traçado de filogenias com base em métodos de maximum likelihood. Interpretação de filogenias para formular hipóteses sobre a relação do SARS-Cov-2 com outros coronavírus. 30% da aula foi leccionada pelo Prof. Vitor Sousa.


Introdução ao traçado de filogenias com base em dados moleculares

16 Maio 2025, 11:00 Margarida Maria Demony de Carneiro Pacheco de Matos

Construção de filogenias com dados de sequências de RNA de diferentes coronavirus. Diferentes passos da construção de filogenias com base em dados moleculares foram abordados: (i) alinhamento de sequências; e (ii) traçado de filogenias com base em métodos de maximum likelihood. Interpretação de filogenias para formular hipóteses sobre a relação do SARS-Cov-2 com outros coronavírus. 


Introdução ao traçado de filogenias com base em dados moleculares

15 Maio 2025, 17:30 Margarida Maria Demony de Carneiro Pacheco de Matos

Construção de filogenias com dados de sequências de RNA de diferentes coronavirus. Diferentes passos da construção de filogenias com base em dados moleculares foram abordados: (i) alinhamento de sequências; e (ii) traçado de filogenias com base em métodos de maximum likelihood. Interpretação de filogenias para formular hipóteses sobre a relação do SARS-Cov-2 com outros coronavírus. 


Traçado de filogenias, conceitos gerais (conclusão); Métodos de Inferências filogenéticas

15 Maio 2025, 16:00 Margarida Maria Demony de Carneiro Pacheco de Matos

Estimando o tempo de divergência 

As filogenias descrevem padrões de diversificação..por vezes espantosos…
Como se inferem filogenias? Objetivos e dificuldades 
Métodos de traçado de filogenias: Parcimónia; Métodos de distância; Grande problema de métodos de distâncias 
Quantas árvores? E como decidir? Definição final de árvore de consenso
Filogenia e confiança estatística: bootstrap
Outras evidências para reconstruir árvores filogenéticas: os fosseis
A filogeografia


Introdução ao traçado de filogenias com base em dados moleculares

15 Maio 2025, 13:00 Vítor Sousa

Construção de filogenias com dados de sequências de RNA de diferentes coronavirus. Diferentes passos da construção de filogenias com base em dados moleculares foram abordados: (i) alinhamento de sequências; e (ii) traçado de filogenias com base em métodos de maximum likelihood. Interpretação de filogenias para formular hipóteses sobre a relação do SARS-Cov-2 com outros coronavírus.