Métodos básicos de anotação da cromatina

28 Fevereiro 2019, 11:00 • Rui Artur Paiva Loureiro Gomes

Exemplos de utilização de RNA-seq e outros métodos de análise à escala genómica para elucidar a estrutura e expressão génica nos projetos modENCODE. Breve revisão da estrutura da cromatina, nucleossomas, modificações pós-tradução e “código das histonas”. Modelo de propagação das marcas epigenéticas. Métodos básicos de anotação da cromatina: DNASE-SEQ, DNASE-CHIP, ChIP-CHIP, ChIP-SEQ, FAIRE-SEQ e BS-SEQ. Exemplos de aplicação destes métodos nos projetos ENCODE para elucidar a estrutura e função da cromatina. Assinaturas típicas da transcrição, das origens de replicação e dos diversos tipos de heterocromatina. As enigmáticas regiões HOT (elevada ocupação de fatores de transcrição). As principais conclusões do projeto ENCODE e suas controvérsias.

Deteção de Polimorfismos Humanos - Parte I

27 Fevereiro 2019, 14:00 • Ana Rita Barreiro Alves de Matos

Deteção de Polimorfismos Humanos - Parte I

-Informações sobre o funcionamento da disciplina e trabalho laboratorial

-Introdução teórica sobre os polimorfismos a analisar e revisões sobre PCR e electroforeses  

-Extração de DNA de células da mucosa bucal dos alunos

-PCR (calculo de TM, preparação do mastermix e programação do termociclador)

Deteção de Polimorfismos Humanos - Parte I

27 Fevereiro 2019, 08:00 • Ana Rita Barreiro Alves de Matos

Deteção de Polimorfismos Humanos - Parte I

-Informações sobre o funcionamento da disciplina e trabalho laboratorial

-Introdução teórica sobre os polimorfismos a analisar e revisões sobre PCR e electroforeses  

-Extração de DNA de células da mucosa bucal dos alunos

-PCR (calculo de TM, preparação do mastermix e programação do termociclador)

Not Taught.

21 Fevereiro 2019, 14:00 • Rui Artur Paiva Loureiro Gomes

As aulas práticas só têm início na semana seguinte ao início das aulas teóricas

Apresentação. Os projetos ENCODE e modENCODE e a anotação do genoma dos eucariotas

21 Fevereiro 2019, 11:00 • Rui Artur Paiva Loureiro Gomes

Apresentação dos objetivos, programa, organização, bibliografia e métodos de avaliação da unidade curricular. Os projetos ENCODE e modENCODE e a anotação dos genomas em eucariotas. Genes, cromossomas e epigenética. Visão geral da expressão génica. Métodos de análise dos elementos estruturais e funcionais à escala do genoma ("genome-wide"): Microarranjos de DNA ("microarrays") e sequenciação de elevado rendimento ("high-throughput next-generation sequencing (NGS)", "deep sequencing", ou "massive parallel sequencing"). Microarranjos de um canal ou dois canais. Microarranjos de exões ("exon arrays") e microarranjos de genoma ladrilhado ou imbricado ("tiling arrays").