Sumários

Case Study 4 - Segmentation in Drosophila embryos.

16 Março 2022, 08:00 Rui Artur Paiva Loureiro Gomes

Case Study 4 - Segmentation in Drosophila embryos.


Organismos modelo e seus genomas

10 Março 2022, 11:00 Rui Artur Paiva Loureiro Gomes

Conclusão da análise do caso de estudo da semana anterior: mecanismos de estabelecimento e manutenção de imprinting paterno e materno. O que define um modelo biológico? Vantagens e fragilidades dos organismos-modelo Saccharomyces cerevisiae, Caenorhabditis elegans, Drosophila melanogaster, Arabidopsis thaliana Mus musculus.  Caso de estudo: regeneração em Planaria e a utilidade da técnica de RNAi na produção de fenótipos mutantes num organismo pouco adequado à análise genética


Genomas, cromossomas e epigenética

3 Março 2022, 11:00 Rui Artur Paiva Loureiro Gomes

Progressos na anotação genómica e aspetos gerais das bases de dados ENSEMBL, GENCODE, USCS, NCBI e RefSeq. Principais assinaturas epigenéticas dos candidatos a elementos cis-reguladores. Organização do genoma e expressão génica. Estrutura da cromatina. Polycomb, Thritorax e remodelação da cromatina. Variegação por efeito de posição e heterocromatina. Assinaturas epigenéticas do DNA e histonas e os estados da cromatina. Estudo de caso de imprinting genómico.


Apresentação da unidade curricular. Bases da Análise Genética e do Projeto ENCODE

24 Fevereiro 2022, 11:00 Rui Artur Paiva Loureiro Gomes

Apresentação dos objetivos, programa, organização, bibliografia e métodos de avaliação da unidade curricular. Importância e utilidade da análise genética. Contributos dos projetos ENCODE e modENCODE para a anotação de RNAs funcionais e de novos elementos funcionais do genoma humano e do genoma de organismos-modelo. A primeira fase do projeto ENCODE e a definição de gene. A segunda fase do projeto ENCODE e a transcrição pervasiva. Métodos de anotação da cromatina. Conciliação das evidências de função obtidas por métodos bioquímicos, genéticos e evolutivos. A terceira fase do projeto ENCODE e o repositório de candidatos a elementos cis-reguladores humanos e de ratinho.