Sumários

T6

28 Outubro 2024, 16:00 • Ana Filipa Ferreira do Vale

Genómica comparativa: alinhamento múltiplo de sequências e suas aplicações, mapas de sintenia e sequence logos. Introdução à filogenética: evolução de genes e sequências como relógios moleculares.

TP5

23 Outubro 2024, 09:00 • Ana Filipa Ferreira do Vale

Anotação do genoma, determinantes de virulência e resistência a antibióticos.

Apresentação do projeto a realizar pelos alunos.

T5

21 Outubro 2024, 16:00 • Ana Filipa Ferreira do Vale

Tópicos em genómica comparativa e análise de sequências. Compreensão de alinhamentos locais e globais. Matrizes de pontuação para comparação de sequências. Dotplots. BLAST (ferramenta básica de pesquisa de alinhamento local).

TP4

16 Outubro 2024, 09:00 • Ana Filipa Ferreira do Vale

Assembly de novo de genomas bacterianos. Cálculo de parâmetros estatísticos para avaliação da qualidade do assembly, incluindo métricas como N50, tamanho total dos contigs, número de contigs e cobertura.

T4

14 Outubro 2024, 16:00 • Ana Filipa Ferreira do Vale

Métodos de genome assembly, destacando de novo genome assembly e reference-guided assembly, além de pipelines para hybrid assembly que combinam tecnologias de sequenciação. Discussão de artigos científicos que ilustram a aplicação prática dessas metodologias.

Anotação de genomas recorrendo a métodos intrínsecos e extrínsecos de anotação. Principais pipelines utilizadas para a anotação eficiente de genes.