Sumários

TP3

9 Outubro 2024, 09:00 Ana Filipa Ferreira do Vale

Avaliação da qualidade de sequências obtidas por Next generation sequencing recorrendo ao FastQC e sua melhoria  com recurso ao programa Timmomatic.


T3

7 Outubro 2024, 16:00 Ana Filipa Ferreira do Vale

Realização do quizz 1.
A importância da avaliação da qualidade das sequências geradas por tecnologias de Next Generation Sequencing (NGS) para garantir a integridade dos dados. Principais métodos de diagnóstico para identificar problemas, como a presença de sequências de baixa qualidade ou contaminantes. Estratégias de melhoria, incluindo a remoção de artefactos indesejados e a otimização da qualidade das sequências, assegurando resultados mais precisos e confiáveis para análises subsequentes


TP2

2 Outubro 2024, 09:00 Ana Filipa Ferreira do Vale

Introdução à linha de comandos para a genómica e bioinformática.


T2

30 Setembro 2024, 16:00 Ana Filipa Ferreira do Vale

Tecnologias de sequenciação. Sequenciação de DNA de primeira geração. Sequenciação shotgun. Sequenciação de segunda, terceira e quarta geração. Avanços e descobertas significativas exemplificadas pela análise de métodos usados em dois artigos científicos.


TP1

25 Setembro 2024, 09:00 Ana Filipa Ferreira do Vale

Apresentação do programa das aulas teórico-práticas. 

Formatos de ficheiros usados em genómica: fasta e genbank. 
Resolução de problemas.