Sumários

Genómica 2

19 Outubro 2018, 09:00 Maria Helena Machado Trindade de Donato

Apresentação de do software bioinformático Geneious: ligação ao GenBank para pesquisa por genes e nucleótidos. Alinhamento de sequências e identificação de regiões de identidade. Desenho de primers para amplificação de genes específicos. Pesquisa de motivos característicos presentes em regiões conservadas.


Genómica 2

19 Outubro 2018, 08:00 Maria Helena Machado Trindade de Donato

Alinhamento de sequências e sequência consensus. Identidade, similaridade e homologia, genes ortólogos e parálogos. Assemblagem e anotação de genomas.



Genómica 1

17 Outubro 2018, 10:00 Maria Helena Machado Trindade de Donato

Métodos Biomoleculares utilizados na Genómica. Revisão de alguns conceitos: De onde provém a variabilidade do genoma, com particular destaque para SNPs e InDel. A sequenciação pelo método Sanger e novas plataformas de sequenciação de genomas (NGS): Roche 454, Illumina e Nanopore; principais diferenças entre os vários métodos de sequenciação, vantagens e desvantagens de cada uma delas.


Genómica 1

17 Outubro 2018, 09:00 Maria Helena Machado Trindade de Donato

Métodos Biomoleculares utilizados na Genómica. Revisão de alguns conceitos: De onde provém a variabilidade do genoma, com particular destaque para SNPs e InDel. A sequenciação pelo método Sanger e novas plataformas de sequenciação de genomas (NGS): Roche 454, Illumina e Nanopore; principais diferenças entre os vários métodos de sequenciação, vantagens e desvantagens de cada uma delas.


Tecnologias utilizadas no estudo do RNA

15 Outubro 2018, 10:00 Rita Zilhão

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Tecnologias utilizadas no estudo do RNA: Metodologias e abordagens experimentais onde as moléculas de RNA são utilizadas como ferramentas de base para responder a questões biológicas específicas. Os diferentes pipos de RNA. Técnicas bioquímicas clássicas: transcrição in vitro, electrophoretic mobility shift assay (EMSA), super electrophoretic mobility assay, filter binding assay, nucleasse protection assay, run-on assay. Tecnologias mais actuais: imunoprecipitação de RNA (RIP) e RNA pull-down, RNA-assisted RNA chromatography,. O processo biológico de RNA de interferência (RNAi). Mecanismo geral de RNAi. Tecnologia de RNAi – ferramentas e estratégias; análise funcional da acção de RNAi. Aplicações e exemplos da tecnologia de RNAi.