Sumários

Aula 13 - PL (compensação da aula 17.março)

31 Maio 2017, 11:00 • Lisete Maria Ribeiro de Sousa

Resolução do ex. 10 no R: identificação de genes diferencialmente expressos packages limma e RankProd.

Resolução de exercício em R com dados de RNA-Seq. 
Nota: aula lecionada em simultâneo com MEB (9 alunos).

Aula 13 (compensação aula 17.março)

31 Maio 2017, 09:30 • Lisete Maria Ribeiro de Sousa

Metodologias estatísticas para análise de dados de RNA-Seq: métodos baseados em contagens bibliotecas EDASeq e DESeq do Bioconductor.

Aula lecionada em simultâneo com MEB (9 alunos).

Aula 12 - PL

26 Maio 2017, 16:00 • Lisete Maria Ribeiro de Sousa

Resolução do ex. 9: Normalização biblioteca limma.

Nota: aula lecionada em simultâneo com MEB (11 alunos).

Aula 12

26 Maio 2017, 14:30 • Lisete Maria Ribeiro de Sousa

Métodos de correção para comparações múltiplas baseados na FWER e na FDR: Bonferroni, Holm, Benjamini e Hochberg.

Microarrays: Normalização; Metodologias estatísticas para análise de dados de microarrays: testes de permutações; métodos bayesianos e modelos lineares biblioteca limma do Bioconductor; métodos não paramétricos baseados em ordens biblioteca RankProd do Bioconductor;
Nota: aula lecionada em simultâneo com "Métodos Estatísticos em Bioinformática" (11 alunos).

Aula 11 - PL

19 Maio 2017, 16:00 • Lisete Maria Ribeiro de Sousa

Exemplo guiado no R: métodos de classificação supervisionada e não supervisionada.

Nota: Aula lecionada com MEB (12 alunos).