TP02. Introdução à Sistemática Filogenética 2

2 Março 2023, 14:30 Pedro Daniel Mocho Lopes

Introdução e prática em Mesquite. Introdução e prática em TNT. Abertura de bases de dados de caracteres morfológicos em TNT. Seleção de outgroup e ingroup. Verificar e modificar estados de caracter (additive, active, etc.). Aplicação de Equal weight e implied weight. Introdução aos diferentes tipos de análise: Implicit enumeration, Tradicional Search e New Technology Search. Como obter o número de árvores, longitude (tree lenght)? Introdução ao Tree view. Identificação de sinapomorfias e autapomorfias locais com base nas topologias existentes. Mapear sinapomorfias. Mapear caracteres. Estabelecer árvores de consenso [Strict (=Nelsen) e Majority Rule). Identificar wild-card taxa (Pruned Trees). Avaliar grau de suporte dos ramos (Bootstrap, Jacknife, Symmmetric resampling y BREMER support). Estatísticas descritivas e utilização stats.run. Definição dos objetivos do primeiro protocolo prático.

- Goloboff PA, Catalano SA. 2016. TNT version 1.5, including a full implementation of phylogenetic morphometrics. Cladistics, 32: 221–238.
- Goloboff PA, Farris JS, Nixon KC. 2003. T.N.T.: tree analysis using new technology. Program and documentation. Available at www.zmuc.dk/public/phylogeny/tnt
- Goloboff P, Farris J, Nixon K. 2008. TNT, a free program for phylogenetic analysis. Cladistics, 24: 774-786.