Sumários

Sinalização celular: sintese e transporte das moleculas de sinalização

2 Maio 2022, 13:00 Federico Herrera Garcia

Nesta classe, descrevemos os diferentes tipos de moléculas de sinalizaçã

Proteínas de sinalização codificadas por genes:

-Citocinas, factores de crescimento e hormonas peptídicas

-Moléculas de adesão de células: integrinas e cadherinas

Moléculas orgânicas mais pequenas, sintetizadas por enzimas:

-Neurotransmissores (pequenas moléculas hidrofílicas)

-Hormonas lipídicas (hidrofóbicas): Esteróides, derivados do colesterol; e Eicosanóides, derivados do ácido araquidónico

-Hormonas gasosas: Óxido Nítrico (NO), Monóxido de Carbono (CO) e Sulfureto de Hidrogénio (H2S)

-Hormonas vegetais: auxinas, giberelinas, citocininas, ácido abscísico e etileno

Depois descrevemos como são sintetizadas, amadurecidas e armazenadas. Explicámos a endo e exocitose, o transporte axonal, e a sinalização com membrana. Explicámos como são transportados para os tecidos e células alvo, e demos uma série de exemplos de proteínas transportadoras abundantes no plasma. 


Sinalização celular: conceitos gerais (10/13)

26 Abril 2022, 17:00 Federico Herrera Garcia

Nesta aula foi feita uma panorâmica dos passos da comunicação célula a célula, das moedas de sinalização e da evolução destes processos. O conceito de vida foi discutido, e passamos pela evolução dos organismos desde entidades unicelulares a pluricelulares e à formação de órgãos e tecidos complexos. Depois passamos a falar sobre como estes são coordenados, e como a sinalização e a comunicação célula a célula controlam o metabolismo, a proliferação, a sobrevivência, os sentidos, etc... Discutimos como isto é feito a nível molecular, por meio de diferentes moedas de sinalização, tais como modificações pós-tradução, interacções proteína-proteína ou alterações na localização intracelular. Discutimos depois as etapas envolvidas em qualquer processo de comunicação: síntese e secreção de moléculas de sinalização, transporte para células alvo, ligação a receptores, transdução do sinal, integração de diferentes sinais e terminação do sinal. Classificámos e explicámos os tipos de sinalização que ocorrem nos tecidos de formigas celulares: parácrino, endócrino, sináptico,... Demos exemplos de todos estes fenómenos.


TP1 Diferenciação celular e inducible pluripotent stem cells

26 Abril 2022, 16:00 Federico Herrera Garcia

Utilizei os TPs para reforçar conceitos teóricos fundamentais, mas salientando a relevância prática da sinalização celular. Seleccionei uma série de artigos e vídeos de investigação sobre 4 temas principais: Diferenciação de células estaminais, GPCRs, Apoptose, e Optogenética. Os vídeos eram frequentemente feitos em linguagem leiga para o público, e os artigos eram de investigação científica de núcleo duro. Também foram submetidos a um artigo de revisão para apoio. Os estudantes tinham de ler o artigo de investigação e ver o vídeo antes da aula de TP. Uma vez na aula (remota), discutia-se ambos e resolviam-se dúvidas, e depois realizava-se um teste sobre eles. Este primeiro TP estava sobre diferenciação de células estaminais e os estudantes visualizavam um vídeo sobre a descoberta seminal de células estaminais pluripotentes induzíveis (iPSCs) por Yamanaka et al. Isto dava-nos a oportunidade de recordar a relevância dos factores de transcrição a jusante da maioria das vias de sinalização do destino das células, tecidos e organismos.
Recursos:

Video, interview Yamanaka: https://youtu.be/Q9-4SMGiKnE

Research Article (Yamanaka): https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0092867406009767

Review Article (Support): https://doi.org/10.1038/s41576-019-0100-z


TP1 Diferenciação celular e inducible pluripotent stem cells

26 Abril 2022, 15:00 Federico Herrera Garcia

Utilizei os TPs para reforçar conceitos teóricos fundamentais, mas salientando a relevância prática da sinalização celular. Seleccionei uma série de artigos e vídeos de investigação sobre 4 temas principais: Diferenciação de células estaminais, GPCRs, Apoptose, e Optogenética. Os vídeos eram frequentemente feitos em linguagem leiga para o público, e os artigos eram de investigação científica de núcleo duro. Também foram submetidos a um artigo de revisão para apoio. Os estudantes tinham de ler o artigo de investigação e ver o vídeo antes da aula de TP. Uma vez na aula (remota), discutia-se ambos e resolviam-se dúvidas, e depois realizava-se um teste sobre eles. Este primeiro TP estava sobre diferenciação de células estaminais e os estudantes visualizavam um vídeo sobre a descoberta seminal de células estaminais pluripotentes induzíveis (iPSCs) por Yamanaka et al. Isto dava-nos a oportunidade de recordar a relevância dos factores de transcrição a jusante da maioria das vias de sinalização do destino das células, tecidos e organismos.
Recursos:

Video, interview Yamanaka: https://youtu.be/Q9-4SMGiKnE

Research Article (Yamanaka): https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0092867406009767

Review Article (Support): https://doi.org/10.1038/s41576-019-0100-z


Bioquímica para além do estado estacionário

12 Abril 2022, 17:00 Fernando Jose Nunes Antunes

Escalas de tempo:

  • Transição entre estados estacionários
  • Escalas de tempo, o braço direito do bioquímico: o que são, para que servem?
  • Tempo de turnover, número de turnover e tempo de meia vida.
  • Determinação experimental do tempo de turnover.

Sistemas com retroação negativa:

  • Dinâmica oscilatória

Sistemas com retroação positiva:

  • Bifurcação fenotípica