Sumários
Analise de imagens com ImageJ
28 Abril 2022, 08:00 • Federico Herrera Garcia
Nesta aula, dei aos alunos um protocolo detalhado para a análise das imagens de imunocitoquímica através do ImageJ, e disponibilizei um fórum para abordar as suas questões e dúvidas. Os estudantes tiveram que analisar a fluorescência total em 10 imagens, e a fluorescência nuclear e citosólica num mínimo de 150 células em pelo menos 3 imagens diferentes. Acompanhei-os em cada passo do protocolo e discuti as suas dificuldades, desde a análise das imagens até à apresentação dos resultados. Expliquei que os dados deveriam ser apresentados com 1) imagens representativas dos resultados da experiência; 2) gráficos de barras para a fluorescência total; e 3) box plots ou violin plots no caso da translocação de fluorescência para o núcleo. Expliquei como deviam ser analisados os dados em caso de seguir uma distribuição normal ou não normal, e como deviam ser representadas as significações nas gráficas e nas suas legendas. A aula de análise de imagem finalizou com a resolução de uma serie de problemas de imunocitoquímica.
Western Blot
8 Abril 2022, 09:30 • Carlos Miguel Ribeiro da Silva Farinha
Dinâmica da localização celular do factor NF-kB em células HeLa estimuladas por TNFalpha - parte III.
Western Blot
7 Abril 2022, 09:30 • Carlos Miguel Ribeiro da Silva Farinha
Dinâmica da localização celular do factor NF-kB em células HeLa estimuladas por TNFalpha - parte II.
Western Blot
6 Abril 2022, 09:30 • Carlos Miguel Ribeiro da Silva Farinha
Dinâmica da localização celular do factor NF-kB em células HeLa estimuladas por TNFalpha - parte I.
Simulação da via do NF-kB
25 Março 2022, 10:00 • Fernando Jose Nunes Antunes
Simulação de uma via do NF-kB
- Simulação e estudo mecanístico do efeito da duração do estímulo na ativação do NF-kB
- Simulação de "knock-outs" do IkBa e A20
- Estudo do efeito do quociente entre o volume do citosol e do núcleo na ativação do NF-kB
- Simulação da transfeção com IkBa e NF-kB