TP11

24 Maio 2024, 09:00 • Filomena Elisabete Lopes Martins Elvas Leitão

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T12

24 Maio 2024, 08:00 • Filomena Elisabete Lopes Martins Elvas Leitão

Esclarecimento de dúvida. Balanço do semestre.

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TP10

17 Maio 2024, 09:00 • Filomena Elisabete Lopes Martins Elvas Leitão

Pesquisa nas Bases de Dados Crystallography Open Database (www.crystallography.net) e PBD Databank (www.rcsb.org) das estruturas de uma molécula orgânica e de uma proteína. Visualização e análise detalhada dessas estruturas  com recurso ao software Pymol. Construção de um modelo de IA da proteína usando a ferramenta de “Fold Sequence” (https://esmatlas.com/resources?action=fold) do ESM Atlas. Comparação entre o modelo de IA e a estrutura cristalográfica. Exercício de avaliação individual sobre a matéria dada na teórica e o uso de ferramentas computacionais para a visualização de moléculas.

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T11

17 Maio 2024, 08:00 • Filomena Elisabete Lopes Martins Elvas Leitão

Perspectiva histórica sobre a determinação da estrutura das moléculas, com referência aos diferentes métodos experimentais e sua evolução ao longo do tempo (cristalografia de raios-X, espectroscopia de RMN e microscopia electrónica).  Breve referência às bases de dados estruturais de acesso livre em Química e Bioquímica: Crystallography Open Database e PDB Databank (PDBD). A IA em Biologia Estrutural: a base de dados de estruturas de proteínas AlphaFold e a plataforma de previsão de estruturas ESM Atlas.

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Aula TP

10 Maio 2024, 09:00 • Filomena Elisabete Lopes Martins Elvas Leitão

Esta aula foi substituída por uma aula teórica de 2.5h.

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