Sumários

Análise genética em bactérias e em vírus

22 Abril 2022, 11:00 Rui Artur Paiva Loureiro Gomes

Mapeamento dos cromossomas bacterianos por conjugação. Integração das marcas genéticas no genoma bacteriano por dois crossing over (ou mais raramente por quatro crossing-over) que geram apenas um produto viável. Fator F e estirpes F+, F-, Hfr e F'. Merozigotos (ou merodiplóides). Integração e excisão do fator F por um crossing-over entre regiões específicas (IS, insertion sequences do tipo transposão) do cromossoma bacteriano e do Fator F. Recombinação em bacteriófagos. A estrutura fina da região rII do fago T4. A recombinação pode ocorrer dentro do gene. Exemplos de recombinação génica no bacteriófago T4 por crossing-over simples. Testes de Complementação, o teste cis-trans e a definição de gene como unidade funcional. Complementação versus recombinação. Cálculo de frequências de recombinação entre mutantes na região rII do fago T4. Mecanismos de defesa das bactérias contra infeções virais por recurso a sistemas de restrição-modificação, e contra defesa dos bacteriófagos por recurso a metiltransferases e outras proteínas inibitórias das endonucleases de restrição bacterianas. Mecanismos de defesa das bactérias contra genomas invasores (virais e de plasmídeos) por recurso a sistemas do tipo CRISPR-Cas. Mecanismo geral de ação do sistema CRISPR/Cas9 de Streptococcus pyogenes que "vacina" a bactéria contra vírus. Mecanismos de contra defesa viral por recurso a proteínas anti-CRSPR (Acr). Exemplo de como pode ser feita uma edição genómica específica, virtualmente em qualquer organismo vivo, por recurso ao método adaptado de CRISPR-Cas9. Exemplos de recombinação em vírus cujo genoma é RNA, como é o caso do SARS-CoV-2. A recombinação por template switching, aliada à ausência de atividade revisora de prova das polimerases de RNA, contribuem para a produção de novas variantes e para a diversidade dos genomas virais.


Análise genética em bactérias. Meios de seleção de mutantes e de recombinantes. Transformação, transdução e conjugação bacterianas

20 Abril 2022, 11:00 Rui Artur Paiva Loureiro Gomes

Escherichia coli como organismo modelo em genética. Técnicas de cultura e de seleção de bactérias. Estirpes prototróficas, estirpes auxotróficas e meios de seleção. A técnica de repicagem por Replica Plating. Meios de seleção de bactérias auxotróficas, de estirpes resistentes a antibióticos e da capacidade de utilização de açucares complexos como fonte de carbono. A genética das bactérias e dos seus vírus. Processos de transferência génica e de recombinação em bactérias: transformação, transdução e conjugação com transferência de plasmídeos ou de porções do cromossoma bacteriano. Transformação. Integração de marcas genéticas no genoma bacteriano por dois crossing-over que geram apenas um produto viável. Transformantes simples, transformantes duplos e co-transformantes. Introdução aos bacteriófagos. Fagos virulentos, ciclos líticos e transdução generalizada. Fagos temperados, ciclos lisogénicos e transdução especializada. O uso de frequências de cotransformação e cotransdução na inferência de linkage. Inserção do fago lambda no genoma de   E. coli por um crossing over nos locais attB e attP. Produção de fagos lambda defetivos transdutantes para  gal e   bio. Conjugação em   E. coli. Fator F e estirpes F+, F-, e Hfr. Integração e excisão do fator F por um crossing-over entre regiões específicas (IS, insertion sequences) do cromossoma bacteriano e do Fator F.


Mapeamento de mutações. Análise de Pedigrees

12 Abril 2022, 14:00 Rui Artur Paiva Loureiro Gomes

Mapeamento de novas mutações por recombinação meiótica (recombinação homóloga, crossing-over) e por falha de complementação com deficiências citogenéticas. Inferências genéticas por análise de árvores genealógicas (pedigrees).


Mapeamento de mutações. Análise de Pedigrees

12 Abril 2022, 09:00 Rui Artur Paiva Loureiro Gomes

Mapeamento de novas mutações por recombinação meiótica (recombinação homóloga, crossing-over) e por falha de complementação com deficiências citogenéticas. Inferências genéticas por análise de árvores genealógicas (pedigrees).


Mapeamento de mutações. Análise de Pedigrees

11 Abril 2022, 15:00 Rui Artur Paiva Loureiro Gomes

Mapeamento de novas mutações por recombinação meiótica (recombinação homóloga, crossing-over) e por falha de complementação com deficiências citogenéticas. Inferências genéticas por análise de árvores genealógicas (pedigrees).