Continuação do PCR em tempo real

21 Setembro 2016, 09:00 • Rita Zilhão

Continuação do PCR em tempo real: A escolha dos controlos positivos e negativos. A escolha do controlo endógeno. Ensaios de validação, cálculo da eficiência e curvas padrão. Interpretação dos resultados de qPCR e quantificação. Planeamento de um ensaio de PCR. Métodos de quantificação – quantificação absoluta (método da curva padrão), quantificação relativa (método da curva padrão, Ct e Pfaffl). PCR qualitativo – discriminação alélica, a importância da curva de fusão (melting curve). Aplicações do qPCR.

Teórica de Genómica

19 Setembro 2016, 10:00 • Maria Helena Machado Trindade de Donato

Métodos Biomoleculares utilizados na Genómica. Revisão de alguns conceitos: De onde provém a variabilidade do genoma, com particular destaque para SNPs e InDel. Identidade, similaridade e homologia, genes ortólogos e parálogos.

A sequenciação pelo método Sanger e novas plataformas de sequenciação de genomas (NGS): Roche 454 e Illumina; principais diferenças entre os vários métodos de sequenciação, vantagens e desvantagens de cada uma delas. Assemblagem e anotação de genomas.

Apresentação e explicação da organização da disciplina. 1ª tema: PCR em tempo real.

19 Setembro 2016, 09:00 • Rita Zilhão

Apresentação e explicação da organização da disciplina.

PCR em tempo real. Princípios. Sistemas de detecção – compostos de ligação ao DNA não específicos, sondas específicas de sequências. O fenómeno de FRET. Sondas de hidrólise (ex. Taqman), sondas estruturadas (ex. Molecular Beacon), sondas de hibridação (ex. Light Cycler). Vantagens e desvantagens dos diferentes sistemas de detecção.