Sumários

Técnicas de obtenção de organismos transgénicos

11 Outubro 2021, 10:00 Rita Zilhão

Técnicas de obtenção de organismos transgénicos. O que é um organismo transgénico, objectivos da sua construção e suas aplicações. Como se geram animais transgénicos – a escolha do transgene, as estratégias da construção molecular e a expressão do transgene. As células alvo na construção de um transgénico.  Métodos de transferência génica. A inserção aleatória, os efeitos de posição e gene targeting. Os cruzamentos necessários para a obtenção do transgene. A noção de organismo founder. Estratégias de seleção de inserção em locais específicos. Sistemas de expressão induzíveis (Tet ON/Tet OFF) e condicionais (os sistemas Cre/loxP e FLP/FRT). Modificação dirigida de genomas através de nucleases específicas e o sistema CRISPR. Confirmação da obtenção de um transgene. Transgénicos em diferentes modelos animais (ratinho, galinha, zebrafish).  Preocupações éticas.  


Técnicas de obtenção de organismos transgénicos

11 Outubro 2021, 09:00 Rita Zilhão

Técnicas de obtenção de organismos transgénicos. O que é um organismo transgénico, objectivos da sua construção e suas aplicações. Como se geram animais transgénicos – a escolha do transgene, as estratégias da construção molecular e a expressão do transgene. As células alvo na construção de um transgénico.  Métodos de transferência génica. A inserção aleatória, os efeitos de posição e gene targeting. Os cruzamentos necessários para a obtenção do transgene. A noção de organismo founder. Estratégias de seleção de inserção em locais específicos. Sistemas de expressão induzíveis (Tet ON/Tet OFF) e condicionais (os sistemas Cre/loxP e FLP/FRT). Modificação dirigida de genomas através de nucleases específicas e o sistema CRISPR. Confirmação da obtenção de um transgene. Transgénicos em diferentes modelos animais (ratinho, galinha, zebrafish).  Preocupações éticas.  


TP de Genómica

8 Outubro 2021, 09:00 Rita Zilhão

Teórica: Alinhamento de sequências e sequência consensus. Identidade, similaridade e homologia, genes ortólogos e parálogos. Assemblagem e anotação de genomas. Identidade, similaridade e homologia, genes ortólogos e parálogos. Assemblagem e anotação de genomas.

Prática: Apresentação de do software bioinformático Geneious: ligação ao GenBank para pesquisa por genes e nucleótidos. Alinhamento de sequências e identificação de regiões de identidade. Desenho de primers para amplificação de genes específicos. Pesquisa de motivos característicos presentes em regiões conservadas.


TP de Genómica

8 Outubro 2021, 08:00 Rita Zilhão

Teórica: Alinhamento de sequências e sequência consensus. Identidade, similaridade e homologia, genes ortólogos e parálogos. Assemblagem e anotação de genomas. Identidade, similaridade e homologia, genes ortólogos e parálogos. Assemblagem e anotação de genomas.

Prática: Apresentação de do software bioinformático Geneious: ligação ao GenBank para pesquisa por genes e nucleótidos. Alinhamento de sequências e identificação de regiões de identidade. Desenho de primers para amplificação de genes específicos. Pesquisa de motivos característicos presentes em regiões conservadas.


Genómica

6 Outubro 2021, 09:00 Rita Zilhão

Genómica: Métodos Biomoleculares utilizados na Genómica. Revisão de alguns conceitos: De onde provém a variabilidade do genoma, com particular destaque para SNPs e InDel. A sequenciação pelo método Sanger e novas plataformas de sequenciação de genomas (NGS): Roche 454, Illumina e Nanopore; principais diferenças entre os vários métodos de sequenciação, vantagens e desvantagens de cada uma delas