Sumários

TP03. Introdução à Paleohistologia

9 Março 2023, 14:30 • Vanda Arlete Faria dos Santos

Conceito de histologia. Preparação de amostras biológicas para observação ao microscópio. Desenvolvimento embrionário e tipos de tecidos. Tecido ósseo. Tipos de ossificação. Organização da matriz óssea. Vascularização. Remodelação e reabsorção do tecido ósseo. Marcas de crescimento. Metodologia em Paleohistologia. Implicação da Paleohistologia para o estudo do crescimento, idade e maturidade sexual.

Benton, M.J. 2014. Vertebrate Palaeontology. 4th ed. Wiley-Blackwell 480pp.

V. de Buffrénil, A. J. de Ricqlès, L. Zylberberg, & K. Padian (Eds.). 2021. Vertebrate skeletal histology and paleohistology. Taylor & Francis Group, 838 pp. ISBN 9780367700867

T03: Evolução dos primeiros tetrápodes

9 Março 2023, 12:30 • Vanda Arlete Faria dos Santos

Adaptação ao meio terrestre: Suporte, locomoção, alimentação, respiração, órgãos sensoriais, equilíbrio hídrico e reprodução. Tetrápodes devónicos – principais novidades adaptativas. Diversificação dos tetrápodes no Carbónico: formas basais, Temnospondylii, Lepospondyli, Reptiliomorpha. Evolução dos Anfíbios modernos: Albanerpetontidae, Anura, Urodela, Gymnophiona. Mudança climática no final do carbónico. Origem dos Amniotas: (i) Principais tendências evolutivas na morfologia craniana e pós-craniana; (ii) principais novidades evolutivas, a sua evolução inicial, e paleobiologia. Diversificação entre Synasida e Reptilia. Reptilia: Pareptiles e Eureptiles. Synapsida: Synapsidos basais, visão geral da sua filogenia. Therapsida (Biarmosuchia, Dinocephalia, Anomodontia, Gorgonopsia, Therocephalia, formas basais de Cynodontia).

Ahlberg, P. 2018. Follow the footprints and mind the gaps: A new look at the origin of tetrapods. Earth and Environmental Science Transactions of the Royal Society of Edinburgh, 109(1-2): 115-137. DOI:10.1017/S1755691018000695

Benton, M.J. 2014. Vertebrate Palaeontology. 4th ed. Wiley-Blackwell 480pp.

Pough FH, Janis CM, Haiser JB 2008. Vertebrate Life. Pearson Education.

TP02. Introdução à Sistemática Filogenética 2

2 Março 2023, 14:30 • Pedro Daniel Mocho Lopes

Introdução e prática em Mesquite. Introdução e prática em TNT. Abertura de bases de dados de caracteres morfológicos em TNT. Seleção de outgroup e ingroup. Verificar e modificar estados de caracter (additive, active, etc.). Aplicação de Equal weight e implied weight. Introdução aos diferentes tipos de análise: Implicit enumeration, Tradicional Search e New Technology Search. Como obter o número de árvores, longitude (tree lenght)? Introdução ao Tree view. Identificação de sinapomorfias e autapomorfias locais com base nas topologias existentes. Mapear sinapomorfias. Mapear caracteres. Estabelecer árvores de consenso [Strict (=Nelsen) e Majority Rule). Identificar wild-card taxa (Pruned Trees). Avaliar grau de suporte dos ramos (Bootstrap, Jacknife, Symmmetric resampling y BREMER support). Estatísticas descritivas e utilização stats.run. Definição dos objetivos do primeiro protocolo prático.

- Goloboff PA, Catalano SA. 2016. TNT version 1.5, including a full implementation of phylogenetic morphometrics. Cladistics, 32: 221–238.
- Goloboff PA, Farris JS, Nixon KC. 2003. T.N.T.: tree analysis using new technology. Program and documentation. Available at www.zmuc.dk/public/phylogeny/tnt
- Goloboff P, Farris J, Nixon K. 2008. TNT, a free program for phylogenetic analysis. Cladistics, 24: 774-786.

T02: Evolução inicial dos Gnatostomados

2 Março 2023, 12:30 • Pedro Daniel Mocho Lopes

Sinapomorfias do Clado Vertebrata (revisão). Gnathostomata e hipóteses sobre a evolução da mandíbula (Gill Arch hypothesis, Ventilation hypothesis, etc.). Articulação da mandíbula nos membros de Gnathostomata. Placodermi (Acanthothoraci, Rhenanida, Antiarchi, Petalichthyida, Ptyctodontida, Phyllolepida e Arthrodira): principais características, paleobiologia e filogenia (caracterização das suas armaduras ósseas na região da cabeça e ombros). Placodermi é um grupo monofilético ou parafilético? Introdução aos Chondrichthyes. Acanthodii e sua posição filogenética. Osteichthyes: principais características. Tipos de barbatanas. Introdução a Actinopterygii. Sarcopterygii (Actinistia, Onychodontida e Dipnomorpha): principais características, paleobiologia e filogenia. Evolução inicial de Tetrapodomorpha (Porolepiformes, Onychodontida, Rhizodontida, Osteolepidae, Tristichopteridae, Panderichthyida. Faunas do Silúrico e Devónico e Extinção do Devónico superior.

- Benton MJ. 2014 Benton MJ. 2014. Vertebrate Palaeontology. Wiley-Blackwell; 4th edition
- Miyashita T. 2016. Fishing for jaws in early vertebrate evolution: a new hypothesis of mandibular confinement. Biological Reviews 91, 611-657. https://doi.org/10.1111/brv.12187
- Pough FH, Janis CM, Haiser JB 2008. Vertebrate Life. Pearson Education.

TP01. Introdução à Sistemática Filogenética 1

23 Fevereiro 2023, 14:30 • Pedro Daniel Mocho Lopes

Taxonomia e Hierarquia Lineana; Sistemática Filogenética. Escolas Fenética, Evolutiva e Cladística. Definições de Homologia, Homoplasia, Cladograma, Caracter, Estado ancestral = plesiomorfia, Estado derivado = apomorfia e Clado, autapomorfia, plesiomorfia, simplesiomorfia, apomorfia, monofilia, parafilia e polifilia. Matrizes (como construir uma matriz de dados morfológicos). Tipos de Cladograma. Métodos de Codificação e Critérios de otimização dos caracteres. Peso de Caracteres. Representação das árvores filogenéticas. Construção de cladogramas. Estratégia de pesquisas: (i) pesquisa exaustiva; e (ii) Branch and Bound. Métodos de Otimização: Máxima parcimónia, Maximum Likelihood, least-square distances. Árvores de Consenso (Consenso estrito, Consenso semi-estrito, Consenso de Nelson, Consenso de Adams, Consenso de maioria (Majority-Rule). Avaliar o grau de suporte (Bootstrap, Jacknife, Bremer support). Estatísticas descritivas em Máxima Parsimónia. Introdução ao Mesquite. Introdução ao TNT.