Sumários

Discussão de artigos. Preparação das apresentações.

21 Outubro 2024, 09:30 • António Eduardo do Nascimento Ferreira

Discussão de artigos. Preparação das apresentações.

21 Outubro 2024, 09:30 • Bárbara Joana de Almeida Henriques

Discussão de artigos. Preparação das apresentações.

Aula lecionada pelo Professor Cláudio M. Gomes.

Prediction of families, domains and structure from sequence

14 Outubro 2024, 11:00 • António Eduardo do Nascimento Ferreira

Prediction of families and domains from protein sequence. Multiple sequence alignments as the starting procedure in the classification of new proteins. Tools and methods. Deterministic patterns and the tool PROSITE. Position Specific Scoring Matrices and Hidden Markov models The assessment of the performance of methods. The InterPro portal as an aggregative tool for family/domain prediction from sequence. Demonstration of the use of InterPro in a multi-domain protein. The prediction of protein structure (3D) from sequence: a difficult problem in structural biology. The CASP competition. Homology modelling: concept, stages and tools. The quality of the obtained models. Errors and limitations of the results of homology modelling. The portal SwissModel. Template search, modelling and final optimization by empirical force fields. Other methods of structure prediction: the Rosetta fragment approach. The Alphafold method.

Apresentação de artigos

14 Outubro 2024, 09:30 • António Eduardo do Nascimento Ferreira

Apresentação de artigos

Discussão de artigos. Preparação das apresentações.

14 Outubro 2024, 09:30 • Bárbara Joana de Almeida Henriques

Discussão de artigos. Preparação das apresentações.