Protein Data Bank. CATH structural classification

7 Outubro 2024, 11:00 • António Eduardo do Nascimento Ferreira

The Protein Data Bank as a database and portal of structural information. Atomic coordinates and the PDB format. The physical basis of X-ray crystallography. Bragg's law. Protein crystallization, X-ray sources, diffraction patterns and structure factors. Electron density and structural models. Fundamentals about the structural classification of proteins. The CATH structural classification.

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Apresentação de artigos

7 Outubro 2024, 09:30 • António Eduardo do Nascimento Ferreira

Apresentação de artigos

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Discussão de artigos. Preparação das apresentações.

7 Outubro 2024, 09:30 • Bárbara Joana de Almeida Henriques

Discussão de artigos. Preparação das apresentações.

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Protein classification. Predictions from sequence

30 Setembro 2024, 11:00 • António Eduardo do Nascimento Ferreira

General ideas about the classification of proteins. The scope and general mechanism of the prediction of structural and functional features from a protein sequence. Role of MSAs and the inference of signatures.

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Discussão de artigos. Preparação das apresentações.

30 Setembro 2024, 09:30 • Bárbara Joana de Almeida Henriques

Discussão de artigos. Preparação das apresentações.

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