Sumários

Representações da estrutura de proteínas, software UCSF Chimera

29 Setembro 2017, 09:30 António Eduardo do Nascimento Ferreira

Introdução ao software UCSF Chimera: representações da estrutura de proteínas, Diversidade de tamanhos e de estruturas. Exemplos. Exemplo de uma proteína de membrana chimérica. "Edição" simples de estruturas para separar domínios no software de visualização.


Estrutura das proteínas. PDB. Cristalografia de raios X

22 Setembro 2017, 11:00 António Eduardo do Nascimento Ferreira

Generalidades sobre a estrutura de proteínas. Níveis estruturais e representações. Visão moderna sobre o dogma central da biologia molecular. Definição de domínio. Exemplos. Relação entre domínio e subunidade. O Protein Data Bank como base de dados e portal de resultados estruturais. Ficheiros PDB e coordenadas atómicas. Fundamentos sobre a cristalografia de raios X de macromoléculas biológicas: lei da Bragg, cristalização de proteínas, difração e fatores e estrutura, fontes de raios X, densidades electrónicas e modelos estruturais. Validação de modelos estruturais.


Apresentação da UC

22 Setembro 2017, 09:30 António Eduardo do Nascimento Ferreira

Apresentação. Objectivos e normas de funcionamento. Programa da disciplina. Avaliação. Bibliografia.