Hibridação

25 Outubro 2018, 16:30 • Maria Manuela Gomes Coelho de Noronha Trancoso

1ª parte -Conceito de hibridação, introgressão e zonas híbridas. 

Autoavaliação

24 Outubro 2018, 08:00 • Maria Manuela Gomes Coelho de Noronha Trancoso

Discussão sobre vários temas relacionados com a aplicação de diferentes marcadores moleculares.

Aplicação de NGS em populações de mamíferos

23 Outubro 2018, 15:30 • Maria Manuela Gomes Coelho de Noronha Trancoso

Sequenciação com sondas (capture-target resequencing). Diversidade genómica e a história demográfica de populações e detecção de selecção natural. Interpretação de padrões de diversidade e estrutura populacional (Principal Component Analysis – PCA). Exemplo de estudo com “whole genome data”: inferir rotas de dispersão em populações humanas (Out of Africa). Exemplo de estudo com “capture-target resequencing”: inferir padrões de migração entre populações localmente adaptadas de uma espécie não modelo (Peromyscus maniculatus). 

(aula leccionada com a colaboração do Doutor Vitor Sousa)

Autoavaliação

22 Outubro 2018, 08:00 • Maria Manuela Gomes Coelho de Noronha Trancoso

Discussão sobre vários temas relacionados com a aplicação de diferentes marcadores moleculares.

Análise de WGS

18 Outubro 2018, 16:30 • Maria Manuela Gomes Coelho de Noronha Trancoso

Sequenciação de genomas (WGS) para detectar variação a nível populacional. Assembly do genoma e medidas da qualidade da sequenciação  (N50 e L50). Tipos de polimorfismos (e.g. SNPs, STRs, copy number variation). Detecção de SNPs e genótipos com base em NGS (SNP e genotype calling). Exemplos de estudos de whole genome sequencing em humanos, padrões globais da diversidade genómica humana.

(aula leccionada com a colaboração do Doutor Vitor Sousa)