Sumários
Hibridação
25 Outubro 2018, 16:30 • Maria Manuela Gomes Coelho de Noronha Trancoso
1ª parte -Conceito de hibridação, introgressão e zonas híbridas.
Autoavaliação
24 Outubro 2018, 08:00 • Maria Manuela Gomes Coelho de Noronha Trancoso
Discussão sobre vários temas relacionados com a aplicação de diferentes marcadores moleculares.
Aplicação de NGS em populações de mamíferos
23 Outubro 2018, 15:30 • Maria Manuela Gomes Coelho de Noronha Trancoso
Sequenciação com sondas (capture-target resequencing). Diversidade genómica e a história demográfica de populações e detecção de selecção natural. Interpretação de padrões de diversidade e estrutura populacional (Principal Component Analysis – PCA). Exemplo de estudo com “whole genome data”: inferir rotas de dispersão em populações humanas (Out of Africa). Exemplo de estudo com “capture-target resequencing”: inferir padrões de migração entre populações localmente adaptadas de uma espécie não modelo (Peromyscus maniculatus).
(aula leccionada com a colaboração do Doutor Vitor Sousa)
Autoavaliação
22 Outubro 2018, 08:00 • Maria Manuela Gomes Coelho de Noronha Trancoso
Discussão sobre vários temas relacionados com a aplicação de diferentes marcadores moleculares.
Análise de WGS
18 Outubro 2018, 16:30 • Maria Manuela Gomes Coelho de Noronha Trancoso
Sequenciação de genomas (WGS) para detectar variação a nível populacional. Assembly do genoma e medidas da qualidade da sequenciação (N50 e L50). Tipos de polimorfismos (e.g. SNPs, STRs, copy number variation). Detecção de SNPs e genótipos com base em NGS (SNP e genotype calling). Exemplos de estudos de whole genome sequencing em humanos, padrões globais da diversidade genómica humana.
(aula leccionada com a colaboração do Doutor Vitor Sousa)